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1 空間及場地消毒
空氣中存在大量微生物，據報告細菌有25個屬，霉菌有16個屬，還有某些酵母菌，空氣中微生物是食品污染來源之一。食品加工廠生產車間對空氣質量要求嚴格，需進行消毒處理，以往采用較多的紫外線照射法，由于車間濕度大，效果往往不理想。為達到迅速降低空氣中細菌數和保持較長時間潔凈效果，可采用2000 mg/L的二氧化氯噴霧，用量一般按4 mg/m3即可殺滅99.99 %以上的細菌、病毒和霉菌。地板可用250 mg/L的二氧化氯溶液拖抹或沖洗。
2 設備及管道的消毒
食品加工廠往往要求在高度無菌的條件下進行生產，故必需經常保持生產設備及管道的無菌狀態(tài)，使用250-300 mg/L二氧化氯浸泡15-30分鐘即可達到很好的效果，浸泡時尤其要注意盲區(qū)和死角的消毒，最好先排放一些消毒液后再浸泡，較長時間不用的管道可用低濃度(50 mg/L)的二氧化氯浸泡以抑制微生物的生長和繁殖。
3 包裝物的消毒
包裝物與食品直接接觸，其帶菌與否直接影響到食品的質量，潔凈無菌的包裝物對保證食品的質量非常重要，由于食品包裝物通常是PVC或PET等塑料材質制成，高溫高壓的消毒方式顯然不合適，可采用250-300 mg/L的二氧化氯浸泡15-30分鐘(應保證包裝物全部浸沒在配制稀釋好的消毒液中)，若是采用自動洗瓶機清洗包裝瓶，以250-300 mg/L的二氧化氯噴射30-60秒鐘即可達到目的。
4 人員的消毒
葡萄球菌、微球菌在正常人的皮膚、手、口、鼻腔中都很常見，為避免將微生物帶入生產車間，從事生產操作的人員進行消毒是必要的，除穿戴無菌工衣工帽外，操作人員的手部可在肥皂流水初步沖洗后用250 mg/L的二氧化氯浸泡30～60秒鐘，穿套鞋時應先在門外通過放置有高度為10厘米左右的250 mg/L二氧化氯溶液的消毒池。此外，操作人員的無菌工作服，包括上衣、褲、帽、口罩等應經常用100 mg/L的二氧化氯溶液清洗消毒。
5 食品的消毒和保鮮
穩(wěn)定性二氧化氯除了可用于蔬菜和水果清洗用水、魚類和海產品加工用水、肉禽類食品加工用水的處理外，還可直接用于各種食品的消毒和保鮮：對蔬菜和水果采用50 mg/L二氧化氯溶液浸泡或沖淋10-15分鐘可達到消毒的目的,潘永貴等人用50 mg/L的穩(wěn)定態(tài)二氧化氯處理象牙芒果，有顯著的殺菌效果，可有效延長貯期，并有較好的防褐變效果;醬鴨經濃度為100-200 mg/kg的二氧化氯溶液處理2分鐘后，常溫下貯存30天仍可保持較好的品質;二氧化氯對魚、貝類均有較好的防腐效果，用量以不超過0.05 g/kg為宜;用40 mg/L的二氧化氯溶液浸泡對蝦10-20分鐘，再用含20 mg/L二氧化氯的冰塊保鮮，在7-10天儲運后仍保持原有的色、香、味;二氧化氯可直接加入鮮奶中作保鮮劑，在原料奶中加入0.05%-0.1%的二氧化氯對鮮牛奶具有很好的保鮮效果;在啤酒中以不超過3.5 mg/L的量添加二氧化氯，不僅可延長啤酒的保鮮期，而且不影響啤酒的口味;果汁飲料中亦可按產品最終濃度5-10 mg/kg的比例加入二氧化氯保鮮。
